1. Wersenian sodu(EDTA) stosowany do zabezpieczenia krwi w celu późniejszej izolacji: ac zapobiega krzepnięciu krwi, wiąże jony wapnia oraz manganu
2. DNA można wizolować z:
3. W skład DNA wchodzą: ad cukier pentoza, reszta kwasu ortofosforowego
4. Białka SSB(single-suand DNA binding proteins): d żadna odp nie jest prawidłowa
5. Charakterystyczne odcinki nazywane na cześć odkrywcy, powstające podczas procesu elongacji,replikacji to: b fragmenty Okazaki
6. TKM NONIDET używany do izolacji DNA: b niszczy błony komórkowe
7. Zgodnie z zasadą komplementarności: cd G łączy się z C za pomocą mostków wodorowych, A łączy się z T za pomocą 2 mostków wodorowych.
8. Wymień co najmniej cztery składniki mieszaniny reakcyjnej PCR:
a) matryca DNA
b) dNTP
c) woda
d) bufor z Mg2+
9. PCR może być wykorzystywany do:
10. Ile kopii DNA uzyskamy po 5 cyklach PCR: b 32
11. Nieprawdziwe jest stwierdzenie, że: d reakcja PCR zachodzi w jednej stałej temperaturze
12. Podkreślone sekwencje to miejsca, w których zaplanowano zaprojektowanie primerów służących do amplifikacji wytłuszczonego fragmentu DNA. Podaj sekwencję obydwu primerów:
F: 5’ CAGCTCGTATATGTAGTAGC 3’ 2*11 + 4*9 = 36+22 = 58OC
R: 5’ ATCTCATCGATCGTCATCTG 3‘ 2*11 + 4*9= 36+22 = 58OC
13. Długość produktu reakcji PCR może mieć wielkość: c 100 pz – kilku tysięcy pz
14. Do izolacji RNA używamy: a TRIZOL
15. Zgodnie z zasadami układania primerów: abc ilość AT powinna być zbliżona do ilości GC, przy obliczaniu temp przyłączani promerów zalec się używanie prostej reguły wyrażonej wzorem Tm= 2(A+T) + 4(G+C), długość primerów powinna mieć ok. 20 bp
16. Produkt: bcd jest dłuższy od C, A jest najdłuższy, C jest najkrótszy
17. Promotor: ad miejsce startu transkrypcji, u Eucaryota zawiera charakterystyczne sekwencje, tzw. TATA box
18. Dopisz sekwencję mRNA, który powstanie na poniższym fragmencie DNA:
5’-GCTATTGC-3‘ DNA (nic kodująca)
5’-GCUAUUGC-3‘
19. Dojrzewanie mRNA, polega na: ab wycinaniu intronów i składaniu egzonów (splicing), powstaniu na końcu 3’ potranskrypcyjnego RNA sekwencji polimerów (?) na końcu 5’ struktury CAP
20. Proces odwrotnej transkrypcji przeprowadzamy: b używając primera poliT
21. Test RNA przeprowadzamy: acd w przypadku, gdy amplifikowany fragment DNA jest zbyt długi, podczas procedury wykrywanie zrearanżowanych form genu BCR-ABL, odpowiedzi a i c są prawidłowe
22. ESE(exonic splicing enhancers): ab znajdują się w intronach, kodują białka biorące udział w splicingu
23. W proces odwrotnej transkrypcji zaangażowany jest enzym: b primaza poliT zależna
24. Gen fuzyjny BCR-ABL: abcd powstaje na skutek połączenia się protoonkogenu ABL z genem BCR, jest markerem przewlekłych białaczek szpikowych, posiada kilka możliwych zrearanżowanych form (np. izoformę b2a2)
25. Czy podane primery są prawidłowo zaprojektowane. Wyjaśnij dlaczego:
F 5’ CGTAAGTCCACTGATGATCC 3’
R 5’ GGATCATCAGTGGACTTACG 3’
malwusik1990