POLITECHNIKA ŁÓDZKA

Wydział Biotechnologii i Nauk o Żywności

dr hab.inż. Tadeusz Trzmiel prof. PŁ, mgr inż. Marcin Płaczek

Słownik oficjalnych nazw enzymów

ŁÓDŹ 2008

Niniejszy słownik zawierający około 4000 nazw (stan na 05.2007) jest tłumaczeniem oficjalnych nazw enzymów z języka angielskiego na język polski. Powstał na podstawie internetowej bazy danych dotyczącej nomenklatury enzymów, Enzyme Nomenclature Database - ExPASy (Expert Protein Analysis System), znajdującej się pod adresem http://www.expasy.org/enzyme/; adres ten konkretnie odnosi się do Szwajcarskego Instytutu Bioinformatyki w Genewie. Baza ta jest rekomendowana przez Komitet Nomenklatury Międzynarodowej Unii Biochemicznej i Biologii Molekularnej (IUBMB). Przy jego opracowaniu w znacznej mierze wykorzystano dane zawarte w słowniku wydanym w 1985 roku w Postępach Biochemii, a także słowniki chemiczne, biologiczne, itp.

Wskazówki dla korzystających ze słownika.

Słownik zawiera ok. 4000 oficjalnych nazw enzymów ułożonych zgodnie z ich obowiązującą numeracją. Każda nazwa enzymu poprzedzona jest jego numerem np.

EC 1.1.1.1                            Dehydrogenaza alkoholowa

                   numer enzymu                                 zalecana nazwa

W słowniku zastosowano przejrzysty podział na pod-podklasy – każda z nich rozpoczyna się od nowej strony. Dodatkowo umieszczona jest również informacja o klasach i podklasach.

W komputerach z dostępem do sieci internetowej po ustawieniu kursora na numerze enzymu (np. EC 1.1.1.1) i naciśnięciu lewego przycisku myszki użytkownik przeniesiony zostaje do internetowej bazy Enzyme Nomenclature Database ExPASy w języku angielskim (http://www.expasy.org/enzyme/), gdzie może znaleźć informacje np.: o jego nazwie w języku angielskim, rodzaju katalizowanej reakcji, jego alternatywnym nazewnictwie, o kofaktorze biorącym udział w reakcji, a także znaleźć linki do innych uznanych na świecie baz internetowych. Na następnej stronie przykładowo pokazano stronę internetową ExPASy dla dehydrogenzay alkoholowej EC 1.1.1.1

Oznaczenia zastosowane w słowniku:

-   1.1.1.243              Dehydrogenaza karweolowa – niebieski kolor czcionki oznacza, że jest to nowa nazwa enzymu, która nie występowała w starszych słownikach, ale nazwę substratu znaleziono w polskich publikacjach naukowych lub słownikach,

-  1.1.1.143              Dehydrogenaza sekwoitolowa – czerwony kolor czcionki oznacza, że jest to nowa nazwa enzymu, która nie występowała w starszych słownikach; autorowi nie udało się znaleźć tłumaczenia nazwy tego enzymu, jak również nazwy substratu w języku polskim – nazwę enzymu zaproponował autor słownika,

-  1.1.1.139              przeniesiono – nowy numer 1.1.1.21 - żółte tło oznacza, że enzym ma nowy numer w klasyfikacji, zmiana nastąpiła w obrębie tej samej pod-podklasy,

-  1.1.1.171              przeniesiono do EC 1.5.1. – nowy numer 1.5.1.20 – jak wyżej, ale enzym przeniesiono do nowej pod-podklasy,

- 1.1.1.249              usunięto – różowe tło oznacza, że w niniejszym słowniku nie ma enzymu o takim numerze (enzym o takim numerze nie istnieje), mógł występować w starszych klasyfikacjach.

EC 1. OKSYDOREDUKTAZY

EC 1.1. Działające na grupę –OH jako donor

EC 1.1.1. Z NAD+ lub NADP+ jako akceptorem

1.1.1.1                            Dehydrogenaza alkoholowa

1.1.1.2                            Dehydrogenaza alkoholowa (NADP(+))

1.1.1.3                            Dehydrogenaza homoserynowa

1.1.1.4                            Dehydrogenaza (R,R)-butanodiolowa

1.1.1.5                            Dehydrogenaza acetoinowa

1.1.1.6                            Dehydrogenaza glicerolowa

1.1.1.7                            Dehydrogenaza propanodiolofosforanowa

1.1.1.8                            Dehydrogenaza glicerolo-3-fosforanowa (NAD(+))

1.1.1.9                            Reduktaza D-ksylulozowa

1.1.1.10              Reduktaza L-ksylulozowa

1.1.1.11              4-dehydrogenaza D-arabinitolowa

1.1.1.12              4-dehydrogenaza L-arabinitolowa

1.1.1.13              2-dehydrogenaza L-arabinitolowa

1.1.1.14              2-dehydrogenaza L-iditolowa

1.1.1.15              2-dehydrogenaza D-iditolowa

1.1.1.16              2-dehydrogenaza galaktytolowa

1.1.1.17              5-dehydrogenaza manitolo-1-fosforanowa

1.1.1.18              2-dehydogenaza inozytolowa

1.1.1.19              Reduktaza glukuronianowa

1.1.1.20              Reduktaza glukuronolaktonowa

1.1.1.21              Reduktaza aldehydowa

1.1.1.22              6-dehydrogenaza UDPglukozowa

1.1.1.23              Dehydrogenaza histydynolowa

1.1.1.24              Dehydrogenaza chinianowa

1.1.1.25              Dehydrogenaza szykimianowa

1.1.1.26              Reduktaza glioksalanowa

1.1.1.27              Dehydrogenaza L-mleczanowa

1.1.1.28              Dehydrogenaza D-mleczanowa

1.1.1.29              Dehydrogenaza glicerynianowa

1.1.1.30              Dehydrogenaza 3-hydroksymaślanowa

1.1.1.31              Dehydrogenaza 3-hydroksyizomaślanowa

1.1.1.32              Reduktaza mewaldanowa

1.1.1.33              Reduktaza mewaldanowa (NADPH)

1.1.1.34              Reduktaza hydroksymetyloglutarylo-CoA

1.1.1.35              Reduktaza 3-hydroksyacylo-CoA

1.1.1.36              Reduktaza acetoacetylo-CoA

1.1.1.37              Dehydrogenaza jabłczanowa

1.1.1.38              Dehydrogenaza jabłczanowa (dekarboksylująca szczawiooctan)

1.1.1.39              Dehydrogenaza jabłczanowa (dekarboksylująca)

1.1.1.40              Dehydrogenaza jabłczanowa (dekarboksylująca szczawiooctan (NADP(+))

1.1.1.41              Dehydrogenaza izocytrynianowa (NAD(+))

1.1.1.42              Dehydrogenaza izocytrynianowa (NADP(+))

...